Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIRIP3Q9BW71 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIRIP3Q9BW71 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms