Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCG3Q8WXD2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
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