Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC112Q8NEF3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms