Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC155Q8N6L0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC155Q8N6L0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms