Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6AP1Q15904 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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