Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms