Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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NBR1Q14596 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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NBR1Q14596 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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NBR1Q14596 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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NBR1Q14596 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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