Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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HTR4Q13639 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HTR4Q13639 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HTR4Q13639 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HTR4Q13639 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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