Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms