Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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