Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3B2Q13367 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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