Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHAF1AQ13111 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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