Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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KCNH2Q12809 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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KCNH2Q12809 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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KCNH2Q12809 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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KCNH2Q12809 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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KCNH2Q12809 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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KCNH2Q12809 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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KCNH2Q12809 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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KCNH2Q12809 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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KCNH2Q12809 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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KCNH2Q12809 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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KCNH2Q12809 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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KCNH2Q12809 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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