Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CLDN10P78369 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CLDN10P78369 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLDN10P78369 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLDN10P78369 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLDN10P78369 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLDN10P78369 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN10P78369 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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