Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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USP46P62068 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP46P62068 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
USP46P62068 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP46P62068 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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