Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCLMP48507 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms