Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFSF9P41273 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms