Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HOXD12P35452 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD12P35452 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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