Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCR5P32302 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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