Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRGP23470 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms