Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP4AP20648 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms