Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PTPRAP18433 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PTPRAP18433 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PTPRAP18433 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PTPRAP18433 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PTPRAP18433 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PTPRAP18433 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PTPRAP18433 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PTPRAP18433 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRAP18433 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRAP18433 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRAP18433 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRAP18433 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRAP18433 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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