Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYN1P17600 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYN1P17600 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYN1P17600 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYN1P17600 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYN1P17600 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYN1P17600 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYN1P17600 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYN1P17600 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYN1P17600 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYN1P17600 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms