Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAV1P15498 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VAV1P15498 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms