Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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