Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODC1P11926 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms