Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB3O43889 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB3O43889 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB3O43889 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB3O43889 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB3O43889 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB3O43889 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB3O43889 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB3O43889 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CREB3O43889 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms