Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms