Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TO15178 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TO15178 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TO15178 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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