Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK3Q9UBP4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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