Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PEMTQ9UBM1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms