Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHST12Q9NRB3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms