Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PFDN4Q9NQP4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PFDN4Q9NQP4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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