Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM5Q9C035 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms