Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms