Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SMIM3Q9BZL3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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