Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms