Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP58Q9BVL2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms