Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLF1Q9BQI6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms