Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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YME1L1Q96TA2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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YME1L1Q96TA2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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YME1L1Q96TA2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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YME1L1Q96TA2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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YME1L1Q96TA2 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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YME1L1Q96TA2 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YME1L1Q96TA2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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