Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGR3Q8TD06 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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