Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms