Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR44Q5JSH3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR44Q5JSH3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms