Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRIM16LQ309B1 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRIM16LQ309B1 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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