Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC6Q16204 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms