Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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R3HDM1Q15032 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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R3HDM1Q15032 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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R3HDM1Q15032 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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