Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP1Q13835 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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