Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEUROD1Q13562 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEUROD1Q13562 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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