Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ATRQ13535 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
ATRQ13535 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
ATRQ13535 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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