Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM28Q13263 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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